故事讲述的是阿U和他的小伙伴们看守的那颗巨大的超级萝卜有天突然变小了，大家致电博士博士怀疑巨石阵的土壤含有某种只对大萝卜有作用的特殊物质，而现在这些物质已经受到了破坏，大萝卜得不到营养开始萎缩。博士推测萝卜岛上一定还有同样的土壤，可以让大萝卜恢复原状。孩子们主动要求承担这个寻找土壤的任务，为了帮助大家，博士送来一只名叫兔智的机器人，它不仅智慧超群，还拥有各种能力。同时，U妈因为思子心切，来到萝卜岛。一行人带着超级萝卜乘坐飞艇展开拯救超级萝卜之旅。但是以兔菲为首的三只兔子依旧不死心，它们一路跟随着阿U他们，发誓一定要得到超级萝卜
